化学法检测RNA修饰-m5C(Bisulfite-seq) 和 Ψ (BID-seq)
2024-03-08 01:59
化学法检测是利用化合物，例如亚硫酸氢盐（Bisulfite，BS）处理RNA，在单碱基水平对RNA修饰进行检测。常用来检测m5C（Bisulfite-seq）和Ψ（BID-seq）。 Bisulfite-seq 原理是BS处理后未甲基化的C会被转变成U，而发生甲基化的C不发生改变，通过对处理后的RNA进行建库测序分析，进而对RNA上的m5C位点进行检测。 BID-seq原理是BS处理后， Ψ被转变成Ψ-BS复合物，在反转录过程中Ψ-BS位点会缺失，因此对BS处理后的RNA进行建库测序，可以检测RNA上的Ψ位点。
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